全外显子测序可作为结构异常胎儿常规检测后的有力补充( 二 ) 背景介绍2-3％的新生儿会发生结构畸形

大部分结构畸形的原因并不明确，随着测序技术的发展，全外显子测序已被证明是产后患者寻找病因的强大工具，平均诊断阳性率达到25%左右。这种技术也被逐步地应用到产前， Carss等对30例结构畸形、芯片检测阴性的胎儿进行全外显子测序， 10%的患者找到致病原因。贝勒医学院杨亚平教授诊断出来自终止妊娠的11个神经系统异常胎儿中的6个，证明使用WES提高了诊断率。然而这些产前WES研究的样本量都太少，使用WES评估更大的样本量不仅可以提供更准确的诊断率，还可以提供其他信息，例如如何根据表型严重程度对亚组进行分类，这有助于鉴定致病变异。

病人入组

从2011年1月至2015年12月，由于在产前超声检查和/或磁共振成像中检测到胎儿结构畸形，共有3988名孕妇被转诊到广州市妇女儿童医疗中心的产前诊断中心。我们中心进行了超声检查和/或磁共振成像确认诊断。异常包括结构畸形，颈部半透明厚度≥3.5mm和囊性水肿。异常不包括孤立的超声软标记，如脉络丛囊肿，心脏或肠中的回声灶，增厚的颈部褶皱，缺乏鼻骨，单脐动脉或持续的右脐静脉。根据侵入性产前检测时的胎龄，使用绒毛膜绒毛取样，羊膜穿刺术和脐带穿刺术收集胎儿样品。