在农业上 ， 褪黑素已经作为一种新的植物生长调节剂和生物刺激剂使用多年 ， 它在促进植物生长 ， 增加产量 ， 促进种子萌发 ， 调节光周期 ， 调控根系发育 ， 延迟叶片衰老 ， 影响果实成熟和贮藏 ， 提高植物抗逆性等方面都有重要作用 。

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由于其具有抗逆性 ， 那些生存条件不好的植物具有更多的褪黑素 ， 那么我们可以推断在大田中生长的植物中 ， 褪黑素的含量要明显高于大棚中的 ， 野生的要高于人工栽培的 。 研究已经证明 ， 植物幼嫩组织的褪黑素含量高于衰老组织；种子里含量最高 ， 而果实中含量最低 ， 人们常吃的葵花籽、甜杏仁和芥菜籽中的褪黑素含量非常高 。 而加工食品中 ， 褪黑素含量非常低 ， 如樱桃果汁和樱桃果干中完全不含褪黑素 ， 但冷冻樱桃和冻干樱桃粉中褪黑素含量则较高 。

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