食道狭窄或蠕动变差：食道接受较高剂量的患者或原先肿瘤较大的患者 ， 会因为食道组织纤维化及神经受损的关系 ， 而造成较为严重的食道狭窄或吞咽困难（约 30%） 。 大约有60% 左右的病患吞咽功能还能维持和原来相同 。 若在放射治疗后接受手术切除食道及重建 ， 则比较不会有此种副作用 。

长期心脏血管毒性：若食道肿瘤位于心脏后方或附近 ， 由于心脏接受的放射剂量较高 ， 在治疗后10－15年发生心肌梗塞、心脏瓣膜闭锁不全/狭窄或心律不整的机率会略为增加 。